在现实世界与网络空间的边界线越来越模糊近未来的日本，玩家们将在网络空间诞生的具有AI（人工智能）的病毒程序称作“数码怪兽”。续作以全新主角视点描绘出《赛博侦探》背后的全新故事。一个因EDEN账号被黑而被冤枉成账号狩猎的少年，为自证清白而投身黑客世界的另一个故事。
大幅强化《赛博侦探》的世界观和游戏系统并展开新的故事，继承了数码宝贝故事系列收集数码宝贝并“冒险”“培育”“战斗”等RPG要素。
